AlexisSaelemaekers è nato il 27 giugno 1999 a Berchem-Sainte-Agathe, cittadina del belgio. E' poi cresciuto nelle giovanili dell'Anderlecht, squadra della Jupiler Pro League belga. Il primo gennaio 2018 approda in prima squadra e, in due anni, ha collezionato 39 presenze e 2 gol. Allo scadere del mercato invernale 2020 i dirigenti rossoneri riescono a portarlo a San Siro. Dopo 7 mesi di prestito, viene acquistato a titolo definitivo il primo settembre, diventando ufficialmente giocatore del Milan per 7,65 milioni. Durante questo periodo milanese arriva a contare 111 presenze in Serie A e 6 gol, di cui il primo assoluto in Italia messo a segno proprio contro il Bologna (18 luglio 2020). Ha avuto così modo di fare anche esperienze Europee: 4 presenze in Europa League e 14 in Champions con 2 gol. Il 30 agosto 2023 si trasferisce a Bologna, con un prestito in scadenza il 30 giugno 2024.